cytoplazmatycznych wtrętów komórkowych należą kropelki lipidów i lipofuscyny. Komórki szyszynki zawierają dużą liczbę wolnych rybosomów oraz mają zdolność pochłaniania radioaktywnego fosforu (32P). Wskazuje to na intensywność procesów przemiany materii w szyszynce, a tym samym na jej dużą aktywność funkcjonalną. W zależności od stanu czynnościowego i wieku można rozróżnić wśród komórek szyszynki komórki główne z jasną, jednorodną cytoplazmą oraz tzw. ciemne, mniejsze i zawierające w cytoplazmie ziarnistości kwasochłonne, a niekiedy zasadochłonne. Do szyszynki wnikają włókna nerwowe rdzenne i bezrdzenne, które krzyżując się tworzą nieregularną sieć. W komórkach oraz między nimi znajdują się często ziarenka brunatnoczarnego pigmentu, szczególnie liczne u konia. U przeżuwaczy