Etymologia słowa koń jest niejasna. Wiadomo, że jest to wyraz rodzimy, ogólnosłowiański (por. np. czes. kůň, białoruskie koń, bułg. kon), kontynuujący prasłowiańską formę *kobnjь, ale dalsza rekonstrukcja jest już niepewna. Przyjmuje się różne warianty, m.in. *kobnjь (por. kobyła), *komnjь lub *komonjь (por. komonica ‘koniczyna’). Praindoeuropejska nazwa konia *ek’uos (zachowana np. w łac. equus) nie jest poświadczona w prasłowiańszczyźnie.