Konstrukcje między X i Y i między X a Y są prawie zawsze wymienne. O pewnych preferencjach na rzecz jednej lub drugiej informuje PWN-owski słownik poprawnej polszczyzny w haśle między, przedstawia jednak raczej zalecenia niż zakazy i nakazy. Jeśli chodzi o Pana pytanie, to zarówno różnica między czarnym i białym, jak i różnica między czarnym a białym zasługuje na aprobatę.