1943r w Góry Świętokrzyskie. Tam objął stanowisko szefa "Kedyw" Oddziału "Jodła" działającego w Okręgu Radomsko - Kieleckim. Zgrupowanie w sile ponad 500 żołnierzy AK m. in. przeciwstawiało się zbrojnie pacyfikacji wsi na kielecczyźnie, którą to z wyrachowaniem przeprowadzał dowódca SS - obersturmfürer Albert Hugo Schuster. Jan Piwnik dowodził w szesnastu różnych walkach wojsk AK. Brał udział m. in. w bitwie tragicznej dla AK koło Bronkowic.<br>Po odwołaniu go z zajmowanego stanowiska został skierowany do Oddziału Nowogródzkiego, gdzie dowodził VII batalionem 77 Lidzkiego Pułku Piechoty AK. Poległ w dniu 16 czerwca 1944 roku w bitwie w miejscowości Jewłasze. Pochowano go na cmentarzu w Wiewiórce