Na pytanie, skąd pochodzą, nawet oni sami nie potrafili odpowiedzieć, twierdząc, że wywodzą się z tajemniczej żyznej ziemi e-la, że są dziećmi Słońca i przybyli z daleka. Uczeni także nie mają w tej sprawie jednolitego zdania. Według antropologów Czirokezi wyszli z dżungli nad Orinoko i z terenów nad Amazonką.<br>Osiemnastowieczny kupiec i historyk James Adair na podstawie czterdziestu lat badań nad obrzędami i zwyczajami Czirokezów wiąże ich rodowód z zaginionym plemieniem izraelskim. Większość uczonych wszakże skłania się ku bardziej prozaicznemu poglądowi: algonkińscy Delawarowie, uważający się za praprzodków wszystkich Indian Ameryki Północnej, wyparli siłą ludy mówiące językiem irokua z północno-wschodniego