1808 r. Jefferson, mimo namowy ze strony przyjaciół, odmówił ubiegania się o trzecią kadencję. Udzielił jednak poparcia aspiracjom prezydenckim Jamesa Monroego z Wirginii. Ale członkowie Kongresu z partii demokratycznych republikanów preferowali Madisona i on uzyskał nominację partii jako jej kandydat na prezydenta.<br>Madison zdecydowanie pokonał kandydata federalistów, Charlesa Coteswortha Pinckneya. Uzyskał w kolegium elektorskim 122 głosy, podczas gdy jego oponent tylko 47. Wiceprezydentem został George Clinton, który uzyskał 113 głosów elektorskich, podczas gdy na federalistę, Rufusa Kinga, padło 47 głosów.<br>James Madison, obejmując urząd prezydenta 4 marca 1809 r., miał 58 lat.<br>Jako prezydent unikał podejmowania decyzji, które mogłyby uchodzić za