Najkorzystniej pod względem dowodzenia funkcjonował 3 batalion pułku morskiego - przez cały czas w kwestiach personalnych i organizacyjnych podlegał dowódcy pułku. Pod względem operacyjnym podlegał dowódcy Obozu Warownego Toruń gen. Hauserowi, a od 22 sierpnia dowódcy grupy płk. Aleksandrowiczowi.<br>Częste zmiany podporządkowania operacyjnego oraz walka na różnych odcinkach frontu osłabiały efekty bojowe pułku morskiego. Niektórzy dowódcy, np. mjr B. Mond - dowódca 205 opp, któremu w rejonie Ostrołęki przez dwa dni podlegały dwa plutony 1 batalionu pułku morskiego, zapomnieli wspomnieć o takich faktach w napisanej przez siebie historii pułku. Zdecydowana jednak większość dowódców grup operacyjnych bardzo pozytywnie oceniała zachowanie marynarzy na bronionych przez