Koźmianowie uczęszczali do szkoły publicznej w Lublinie. Po upływie roku ojciec przeniósł całą trójkę do szkół zamojskich, obawiając się szkodliwego wpływu nauczycieli świeckich na wychowanie religijne synów, szkoła w Lublinie bowiem pozostawała pod kierownictwem Komisji Edukacji Narodowej i zatrudniała nie tylko duchownych. Kiedy jednak władze austriackie wprowadziły do szkół zamojskich język niemiecki (1784), młodzi Koźmianowie powrócili do Lublina i zostali przyjęci od razu do klasy czwartej, ostatecznie zaś ukończyli edukację w roku 1787. Ojciec nosił się początkowo z myślą, aby wysłać chłopców do Akademii Krakowskiej, ale kanonik lubelskiej kapituły, ksiądz Wybranowski, odradził mu ten krok, ostrzegając, iż na uczelni „zapanował prąd