Powszechnymi miejscami metylacji w histonach H3, zarówno w komórkach człowieka, zwierząt, jak i roślin, są reszty lizyny w poz. 9 i 27. Dodatkowo metylowane lizyny występują w poz. 4 (histon H3 gruczołów jądrowych pstrąga) oraz 36 (m.in. w śledzionie człowieka, erytrocytach kury, spermie jeżowca) (por. [P81, s. 122]). Tylko sporadyczne dane dotyczą metylacji histonów lizynowych, spośród których warto odnotować: 1) włączanie radioaktywnej metioniny w histon H2B podczas fazy S cyklu komórkowego w CHO [178]; 2)metylację histonu H2B muszki owocowej pod wpływem szoku termicznego (por. [P81, s. 122]); 3) stwierdzenie, że jedynym histonem ulegającym metylacji u orzęska (Tetrahymena thermophila) jest