W styczniu 1940 r. ks. Piotr wstąpił do tajnej organizacji podziemnej Obwód Związku Walki Zbrojnej w Zakopanem. Przysięgę wojskową odebrał od niego ks. Jasiewicz w obecności komendanta obwodu por. inż. Mariana Moniczewskiego. Przyjął pseudonim "Jordan". W swoim mieszkaniu na wikarówce miał aparat radiowy, prowadził nasłuch, z którego z bratem Stanisławem sporządzali komunikaty. Razem z bratem zajmowali się również kolportażem prasy konspiracyjnej. Jednocześnie ks. Piotr pomagał ludziom, którzy przez Zakopane próbowali przedostać się na Zachód. Wypisywał świadectwa chrztu, na podstawie których wyrabiano niemieckie dokumenty tożsamości, zezwalające na pobyt na terenie Zakopanego. Gestapo kilkakrotnie wpadało na ślad fałszywych zaświadczeń i podejrzewało, że ks