Ca2 w cytoplazmie może indukować wiele destrukcyjnych procesów (m.in. aktywować zależne od Ca2 proteazy i nukleazy) i prowadzić nawet do śmierci komórki. Jednym z mechanizmów działania RFT wywołującego podwyższenie cytoplazmatycznego stężenia Ca2 jest inaktywacja pompy wapniowej, czyli Ca2ATPazy, odpowiedzialnej za aktywny transport jonów wapnia. Może ona być inaktywowana zarówno wskutek bezpośrednich reakcji z RFT, jak też pośrednio, w wyniku oddziaływania produktów peroksydacji lipidów na to integralne białko błony.<br>Stres oksydacyjny wpływa również na funkcje błony plazmatycznej, zwiększając przepuszczalność błony i powodując obniżenie różnicy potencjału elektrycznego pomiędzy wnętrzem komórki a środowiskiem pozakomórkowym (depolaryzację błony). Może to mieć szczególne znaczenie dla pracy