występowanie aminokwasów zasadowych w sześciu zespołach: trzy po dwa aminokwasy (poz. 35­36, 39­40 i 91­92), jeden 3-aminokwasowy (poz. 77­79) oraz jeden 4-aminokwasowy (poz. 16­20). Ich zgrupowanie w N-końcowym obszarze cząsteczki sprawiło, że czysty ładunek aminoterminalnej połowy wynosił +16, a karboksyloterminalnej - tylko +3. Hydrofobowe aminokwasy, a zwłaszcza aromatyczne, są zgrupowane w C-końcowej połowie cząsteczki [163]. Badania sekwencji aminokwasowych histonów H4 wyizolowanych z tak różnorodnego materiału, jak grasica bydlęca i siewki grochu udowodniły niesłychaną konserwatywność ich struktury pierwszorzędowej w procesie ewolucji molekularnej i całkowity brak specyficzności gatunkowej [125]. Obydwa białka, tak odległe filogenetycznie, okazały