Zarówno wydzielana od zewnątrz tkanka elementu, jak i wypełnienie jamy bazalnej są zbudowane z fosforanu wapnia (apatytu). Sposób wzrostu elementu aparatów konodontów nie różnił się więc, tak jak i skład chemiczny, od ząbków skórnych strunowców. Od dawna więc podejrzewano pokrewieństwo konodontów z kręgowcami, homologizując wydzieloną od zewnątrz tkankę elementu z emalią, a wypełnienie jamy bazalnej z dentyną.<br>Podejrzenie to okazało się w pełni uzasadnione po znalezieniu skamieniałości konodontów z zachowanymi śladami tkanek miękkich. Okazało się, że mają ciało o pokroju minoga (ryc. 9.13). Przeciwko jakimkolwiek pokrewieństwom z Chaetognatha świadczy występowanie V-kształtnych segmentów (miomerów) i asymetria płetwy ogonowej. Asymetria ta