chromosomach znajdują się znane ludzkie geny (proces ten nazywamy mapowaniem), postanowił sekwencjonować szybko fragmenty DNA wybrane w sposób przypadkowy z całego genomu. Następnie zamierzał szukać w nich odcinków, których struktura sugeruje, że mogą zawierać geny.<br><br>Dążąc do realizacji tego projektu i próbując opatentować niektóre ze swych osiągnięć Venter wszedł w konflikt z ówczesnym szefem Programu - Jamesem Watsonem. Kiedy odmówiono mu pieniędzy, Venter opuścił rządowy instytut i założył własny - The Institute of Genomic Research (TIGR). Spór z Venterem był również jedną z przyczyn rezygnacji Watsona z kierowania Programem. Zastąpił go na tym stanowisku w 1993 r. i kieruje projektem do dziś Francis