chlorofilu (koncentracji fitoplanktonu). Odcienie od żółtawego do brązowego mogą pochodzić od związków humusowych. Gdy woda jest czysta i pochłania promieniowanie długofalowe, przybiera kolor niebieski, gdy wskutek efektu Tyndalla występuje rozpraszanie światła w cząsteczkach koloidalnych, wówczas przybiera barwę błękitną. Zabarwienie o odcieniu szmaragdowym może być następstwem obecności siarkowodoru, a zielonkawoniebieskie może pochodzić od soli żelaza. Okrzemki mogą nadawać wodzie kolor żółty, a niektóre bakterie nawet kolor malinowy lub czerwony.<br>Pośrednio barwa wody może więc niekiedy wskazywać na jej skład chemiczny, co odzwierciedla się nawet w składzie osadów dennych. Na barwę wód ma także wpływ stopień zachmurzenia, barwa nieba, dominująca barwa brzegów, np