J & S zainteresowały organa ścigania. Płocka policja i prokuratura od końca 1996 r. prowadziły dochodzenie w sprawie niezgodnego z prawem podwójnego fakturowania dostaw oleju opałowego i różnego rodzaju substancji chemicznych eksportowanych przez Petrochemię. Interes polegał na tym, że inne faktury przedstawiano polskim, a inne zagranicznym władzom celnym. Prawdziwą, wyższą kwotę podawano w Polsce, gdyż na wywóz tych substancji i tak obowiązywała zerowa stawka celna. Niższe kwoty (o około dwunastu dolarów za tonę) podawano natomiast zagranicznym celnikom. Chodziło o to, by zapłacić jak najmniejsze cło. W trakcie dochodzenia okazało się, że jednym z największych odbiorców podwójnie fakturowanych towarów była firma J & S