siarczan heparanu proteoglikanem, znajdującym się w glikokaliksie - "płaszczu" złożonych łańcuchów cukrowych wystających z powierzchni komórek (zwłaszcza komórek śródbłonka) i obecnym w substancji podstawowej (matrix) tkanki łącznej. Częściowo tylko enzym znajduje się w płynach pozakomórkowych w postaci nie związanej. Obie pule EC-SOD znajdują się w równowadze dynamicznej. Dożylna iniekcja heparyny uwalnia EC-SOD typu C związaną z heparyną na powierzchni komórek do osocza krwi. Oddziaływanie pomiędzy enzymem a ujemnie naładowanymi wielocukrami ma charakter elektrostatyczny. Cząsteczki enzymu mają wprawdzie wypadkowy ładunek ujemny w fizjologicznym zakresie pH (ich punkt izoelektryczny wynosi 4,5), jednak spośród 222 reszt aminokwasowych tworzących podjednostkę EC-SOD typu