W tych czasach w świątyni poświęconej Apollo i świętym gaju był jeszcze praktykowany kult pogański. Święty Benedykt przekształcił świątynię w kaplicę, dedykując ją świętemu Marcinowi. Później, na przestrzeni wieków, Monte Cassino stało się miejscem świętości, kultury i sztuki. Natomiast klasztor przeszedł w tym czasie burzliwe dzieje. Już w 577 roku został zniszczony przez Longobardów. Czasy świetności rozpoczęły się dla niego dopiero po odbudowie, a po wizycie w 787 roku Karola Wielkiego otrzymał szerokie przywileje. W 883 roku Saracenowie napadli na klasztor, ograbili go, a następnie spalili. Podczas tego najazdu zginął opat święty Bertariusz, założyciel średniowiecznego Cassino. Klasztor odzyskał splendor dopiero w X