nie miał szans na uzyskanie nominacji. Johnson popierał kandydaturę Johna C. Breckinridge'a, który otrzymał nominację południowych demokratów. Popierał Breckinridge'a, ponieważ opowiadał się za jednością kraju i przeciw wystąpieniom stanów południowych z Unii.<br>Kiedy doszło do secesji Południa, Johnson był przeciwny tej decyzji. Konfederaci nienawidzili go. Uważali za zdrajcę, palono jego podobizny, grożono linczem, skonfiskowano mu niewolników, dokonano najazdu na dom i zajęto posiadłość. Nie zmieniło to jego zdania. Uważał secesję za zdradę stanu i potępił ją. Publicznie mówił, że konfederaci winni zdrady powinni być postawieni przed sądem. Był jedynym senatorem południowym, który wzywał Kongres do zapobieżenia secesji i ślubował, że poświęci