pH kształtują procesy gospodarki węglowej organizmów, a także opady, skały podłoża i dopływy wód powierzchniowych i podziemnych do mis jeziornych. Jakkolwiek wody jezior cechuje szeroki zakres zróżnicowania pH, tj. od 4 do 12, zazwyczaj jest on o wiele węższy i najczęściej mają one odczyn słabo zasadowy lub obojętny. W skrajnych przypadkach wody mogą osiągać niezwykle duże wartości zakwaszenia lub alkaliczności. W kraterze wulkanu "Poas w Kostaryce, na wysokości 2400 m n.p.m., jest jezioro o temperaturze wód 85<hi rend="upper">o</>C i pH>1, natomiast w jego pobliżu znajduje się jedyne na Ziemi jezioro ciekłej siarki. Najbardziej zasadowe wody w jeziorach występują na