krystalizacji są białka: kolagen lub ...-proteiny, w osadzie mogą nimi być polisacharydy (chityna), białka keratynowe lub wręcz aragonit, do którego apatyt wykazuje krystalograficzne podobieństwo (w przeciwieństwie do kalcytu, który łatwo podmieniany jest przez krzemionkę). Sfosfatyzowany aragonit zachowuje pierwotny pokrój kryształów.<br>Źródłem jonów fosforanowych są często miękkie tkanki leżącego na dnie ścierwa.<br>Reszty fosforanowe są wszak istotnym składnikiem nośników energii w żywych organizmach. W niektórych typach osadów wapiennych sfosfatyzowane skamieniałości są bardzo liczne. Nie jest związana z jakimkolwiek etapem w ewolucji biosfery fosfatyzacja skamieniałości w środowisku iłu bogatego w organikę. Do najcenniejszych stanowisk tego rodzaju należy późnokambryjska formacja czarnych łupków z konkrecjami