Aparat Golgiego w postaci luźnej siateczki układa się nad jądrem lub na jego wysokości. W powierzchownej części komórki leżą: centrum komórkowe składające się z dwóch centrioli oraz ziarenka brunatnego barwnika, szczególnie liczne u konia, których liczba rośnie z wiekiem. Komórki nabłonkowe pęcherzyków zawierają dobrze wykształconą ergastoplazmę, która podczas zwiększonej czynności tarczycy przekształca się w system szerokich przestrzeni i wodniczek, a ilość kwasu rybonukleinowego maleje. Poza tym w cytoplazmie komórek znajdują się enzymy proteolityczne oraz fosfataza (głównie kwaśna). Jądra komórek tarczycy mają różną wielkość, w zależności od nasilenia procesów wydzielniczych. Wnętrza pęcherzyków wypełnia jednorodna masa zwana koloidem, który zawiera ciała białkowe związane