Warto zauważyć, że omówione metody, w szczególności przybliżenie Huckla, stosują się także do cząsteczek liniowych zawierających atomy połączone wiązaniami Nasuwa to pomysł, aby wybrać współrzędne jąder w inny sposób, tak że każda z nich będzie przedstawiać jedno drganie harmoniczne. Łatwo to zrobić, traktując 3N równań jako układ równań na 3N wielkości qk. Otrzymane współrzędne qk nazywa się współrzędnymi normalnymi układu, a odpowiadające im drgania harmoniczne drganiami normalnymi. Współczynniki Aik tworzą przy tym macierz przejścia pomiędzy