i sierpniu 1920 r. większość stanu osobowego batalionu morskiego wcielono do organizowanego w Toruniu pułku morskiego, którego dowódcą został dowódca batalionu kpt. mar. Konstanty Jacynicz. Pozostałą część batalionu włączono do kompanii portowej Komendy Portu Wojennego Puck. W ten sposób zakończył swoją działalność batalion morski.<br>W okresie swojego istnienia batalion ochraniał 10-kilometrowy odcinek linii demarkacyjnej w rejonie Aleksandrowa Kujawskiego i Nieszawy (przez 212 dni). Następnie przez prawie pół roku dwa marynarskie plutony rozmieszczone w Dębkach oraz Kolibkach koło Orłowa, a także kilkanaście patroli strzegło granicę morską państwa. Oficerowie, podoficerowie i marynarze batalionu tworzyli też zawiązki Dowództwa Wybrzeża, Komendy Portu Wojennego w Pucku