W 1859 r. został rektorem uniwersytetu William and Mary. W 1861 r. przewodniczył konferencji w Waszyngtonie, której zadaniem było zapobieżenie wybuchowi wojny domowej. Jednak w połowie konferencji Tyler opowiedział się za secesją uważając, że przywróci to równowagę między stanami północnymi i południowymi.<br>Kiedy Richmond stał się stolicą konferencji stanów południowych, Tyler przeniósł się do Richmondu i zasiadał w Tymczasowym Kongresie Konfederacji. W listopadzie 1861 r. został wybrany do konfederackiej Izby Reprezentantów.<br>Stan jego zdrowia coraz bardziej się pogarszał. Coraz częściej chorował i coraz częściej czuł się zmęczony. 12 stycznia 1862 r. dostał udaru serca. Sześć dni później zmarł. Miał wówczas 71