Możliwości kolei wynikające z układu przestrzennego sieci wykorzystywane są do obsługi aglomeracji w niewielkim stopniu, przy czym w niektórych przypadkach ma miejsce nawet ograniczanie zakresu usług świadczonych przez PKP. Szczególnie w rejonie Warszawy obserwuje się stale pogarszającą się obsługę podróżnych przez PKP (zmniejszanie częstości ruchu pociągów, wydłużanie rozkładowych czasów przejazdu, nieprzestrzeganie rozkładu jazdy itd.. Nie wykorzystuje się przy tym możliwości technicznych istniejącego taboru dla osiągnięcia większych prędkości przewozów. Warunkiem lepszego wykorzystania kolei do obsługi aglomeracji miejskich jest dostatecznie gęsty ruch pociągów oraz lepsze powiązanie przystanków kolejowych z przystankami komunikacji miejskiej. W wielu przypadkach konieczna jest budowa dodatkowych torów, przeznaczonych dla lokalnego