w pozycji 34 jest niezmienną cechą MnSOD różnego pochodzenia. Cząsteczki MnSOD nie zawierają wewnątrzłańcuchowych mostków disulfidowych, a powierzchnie styków podjednostek w tetramerycznych cząsteczkach MnSOD są mniejsze w porównaniu z Cu,ZnSOD. W tetramerze podjednostki ułożone są stosunkowo płasko wokół pustego wewnątrz rdzenia cząsteczki. Wszystkie te cechy przyczyniają się do mniejszej stabilności MnSOD w porównaniu z Cu,ZnSOD. Chociaż w komórkach eukariotycznych MnSOD jest białkiem mitochondrialnym, kodowana jest przez gen jądrowy. Syntetyzowana jest w związku z tym jako prebiałko zawierające N-końcową sekwencję sygnalną, składającą się z około 30 reszt aminokwasowych, bogatą w reszty aminokwasów zasadowych. Podjednostka pre-MnSOD człowieka zawiera 198