Gwałtowny wzrost liczebny i jakościowy zbiorów nowej biblioteki spowodował trudności lokalowe i kłopoty w zakresie bibliotekarskiego opracowania. Linde czynił starania o pozyskanie dubletów z bibliotek rosyjskich, m.in. z Cesarskiej Biblioteki Publicznej w Petersburgu i prywatnej biblioteki Rumiancewa, ale bezskutecznie.<br> Biblioteka Publiczna 21 listopada 1831 została zamknięta, a Lindemu polecono udzielanie pomocy rosyjskim komisarzom przejmującym jej zbiory, a także księgozbiory z innych likwidowanych bibliotek warszawskich. Był zobowiązany zebrać wszystkie książki wypożyczone z tych bibliotek, a także nadzorować pakowanie i wysyłkę do Petersburga. Na ten cel pobierał pieniądze z kasy państwowej. Ostateczne rozliczenie tych kosztów nastąpiło w maju 1836 roku. W marcu 1832