stresu oksydacyjnego może być podwyższenie stężenia Ca2 w cytoplazmie. Stężenie to jest utrzymywane na bardzo niskim poziomie (0,1-1 molˇl1) dzięki transportowi (głównie aktywnemu) na zewnątrz komórki oraz do wewnątrzkomórkowych magazynów - siateczki śródplazmatycznej i mitochondriów. Znaczne podwyższenie stężenia Ca2 w cytoplazmie może indukować wiele destrukcyjnych procesów (m.in. aktywować zależne od Ca2 proteazy i nukleazy) i prowadzić nawet do śmierci komórki. Jednym z mechanizmów działania RFT wywołującego podwyższenie cytoplazmatycznego stężenia Ca2 jest inaktywacja pompy wapniowej, czyli Ca2ATPazy, odpowiedzialnej za aktywny transport jonów wapnia. Może ona być inaktywowana zarówno wskutek bezpośrednich reakcji z RFT, jak też pośrednio, w wyniku oddziaływania