w życiowych procesach bakterii heterotroficznych lub autotroficznych, występujących w fazie ciekłej jako zawiesina (osad czynny) lub w formie warstewki (filmu) pokrywającej powierzchnię fazy stałej. Źródłem energii wykorzystywanej przez bakterie heterotroficzne jest energia wiązań chemicznych w cząsteczkach przyswajanych związków organicznych (pożywienie). Produktami procesów życiowych są związki organiczne wchodzące w skład komórek (przyrost biomaasy bakterii) oraz ditlenek węgla i woda (końcowe produkty oddychania tlenowego).<br>&lt;gap&gt;<br>Odoranty nieorganiczne, siarkowodór i amoniak, są przyswajane przez autotroficzne bakterie chemosyntetyzujące, wykorzystujące energię takich reakcji chemicznych, jak nitryfikacja (bakterie Nitrosomonas i Nitrobacter) lub utlenianie siarkowodoru do siarki elementarnej i siarczanów (bakterie Thiobacter, Thiobacillus i inne):<br>&lt;gap&gt;<br>Bakterie wykorzystywane w biofiltrach